2012年10月，经国务院批复，中关村国家自主创新示范区由“一区十园”扩大到“一区十六园”，房山区被正式纳入中关村国家自主创新示范区范围。房山园包括五大园区：基地位于房山区“三大城市组团”的燕房组团，总规划面积30平方公里，纳入中关村规划面积749.45公顷，是全国首批62家新型工业化产业示范基地之一，是北京市和中石化进行战略合作的重要载体。燕化公司投资基地的重点项目66项，投资总额240.8亿元。现已建成42个，完成投资112亿元，在建项目12个。社会投资方面，主要有环宇京辉工业气体等18个重点项目，总投资42.5亿元，现有5个已经投产。二、北京高端制造业基地基地位于房山区“三大城市组团”的窦店组团，一期规划面积为5.85平方公里，总规划面积30平方公里，纳入中关村361.24公顷。基地相继引进了长安汽车、中国北车等一批高端装备制造企业，目前长安汽车、京西重工、国能电池、金鹏达4个项目已顺利投产，长安汽车2013年实现产值20.5亿元，2014年预计可以达到100亿元。三、良乡高新技术产业区西区园区位于房山区“三大城市组团”的长阳良乡组团西部，包括良乡经济开发区和知识经济示范区，纳入中关村示范区253.28公顷。 北京良乡经济开发区已基本建成，引进美国的PLP公司、基康公司、日本的助野袜业公司、北京华素制药股份公司等54家企业落户，园区通过特色发展，园区产业结构不断优化，园区各项经济指标发展良好。知识经济示范区目前是北京市六环以里唯一的成片建设用地，总规划面积达6400亩，主要规划建设以科研开发，电子信息等为主的知识经济特色产业。四、良乡高新技术产业区东区园区位于房山区“三大城市组团”的长阳良乡组团的东部，包括长阳科技园和良乡高教园区，纳入中关村规划面积139.16公顷。长阳科技园依托中核集团和航天科工集团，特色发展高端研发制造产业，园区作为“军民融合”典型项目已被中关村列为重点特色发展的军民融合示范基地。目前中核集团东方自控产业化项目即将竣工投产，航天科工集团长阳航天城电子科技园项目已经开工。国家环保部核与辐射安全监管技术研发基地、国防科工局中美核安保示范中心等项目也将陆续开工建设。良乡高教园区依托6所大学的教育资源和人才智力优势，重点特色发展教育、研发服务、文化创意产业，园区科技成果转化及智汇城科技创业园示范基地建设等工作正在全面推进。五、北京海聚工程高科技产业园园区位于良乡卫星城以西，紧紧抓住了国家“千人计划”、北京市“海聚工程”的契机，开始全力打造“海聚基地”这一全新品牌。园区纳入中关村示范区规划面积87.79公顷。目前，园区已有10家高新企业入驻，其中飞航吉达项目已投产，能通科技、永华晴天和西山新干线项目已开工，其它6家企业也将陆续开工。

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